root/test-data/2.bed

Revision 336:58a2fbc66cbc, 4.2 kB (checked in by Jianbin He <jbhe@bx.psu.edu>, 2 years ago)

change test data to smaller ones

Line 
1 chr1    147962192       147962580       NM_005997_cds_0_0_chr1_147962193_r      0       -
2 chr1    147984545       147984630       BC007833_cds_0_0_chr1_147984546_f       0       +
3 chr1    148078400       148078582       AJ011123_cds_0_0_chr1_148078401_r       0       -
4 chr1    148185136       148185276       NM_002796_cds_0_0_chr1_148185137_f      0       +
5 chr10   55251623        55253124        AY029205_cds_0_0_chr10_55251624_r       0       -
6 chr11   116124407       116124501       AK057832_cds_0_0_chr11_116124408_r      0       -
7 chr11   116206508       116206563       NM_000040_cds_1_0_chr11_116206509_f     0       +
8 chr11   116211733       116212337       BC005380_cds_0_0_chr11_116211734_r      0       -
9 chr11   130745911       130745993       AY358331_cds_0_0_chr11_130745912_f      0       +
10 chr12   38440094        38440321        NM_052885_cds_0_0_chr12_38440095_r      0       -
11 chr12   38905200        38905351        AY792511_cds_0_0_chr12_38905201_f       0       +
12 chr13   112381694       112381953       NM_207440_cds_1_0_chr13_112381695_f     0       +
13 chr13   29680676        29680875        NM_032116_cds_0_0_chr13_29680677_r      0       -
14 chr14   98521864        98521922        U88895_cds_0_0_chr14_98521865_f 0       +
15 chr14   98710240        98712285        NM_022898_cds_0_0_chr14_98710241_r      0       -
16 chr15   41486872        41487060        BX537418_cds_0_0_chr15_41486873_r       0       -
17 chr15   41673708        41673857        AK223365_cds_0_0_chr15_41673709_f       0       +
18 chr15   41679161        41679250        NM_153700_cds_0_0_chr15_41679162_r      0       -
19 chr15   41773540        41773689        AK223365_cds_0_0_chr15_41773541_f       0       +
20 chr16   142908  143003  NM_005332_cds_0_0_chr16_142909_f        0       +
21 chr16   179197  179339  BC065198_cds_0_0_chr16_179198_r 0       -
22 chr16   244413  244681  AK057165_cds_2_0_chr16_244414_f 0       +
23 chr16   259268  259383  AB016929_cds_0_0_chr16_259269_r 0       -
24 chr18   23786114        23786321        NM_001792_cds_0_0_chr18_23786115_r      0       -
25 chr18   59406881        59407046        NM_012397_cds_1_0_chr18_59406882_f      0       +
26 chr18   59455932        59456337        AB046400_cds_0_0_chr18_59455933_r       0       -
27 chr18   59528407        59528575        AY792326_cds_0_0_chr18_59528408_f       0       +
28 chr19   59068595        59069564        BC013995_cds_1_0_chr19_59068596_f       0       +
29 chr19   59236026        59236146        NM_198481_cds_0_0_chr19_59236027_r      0       -
30 chr19   59297998        59298008        NM_004542_cds_0_0_chr19_59297999_f      0       +
31 chr19   59318205        59318718        AK128544_cds_3_0_chr19_59318206_r       0       -
32 chr2    118288583       118288668       NM_006773_cds_0_0_chr2_118288584_f      0       +
33 chr2    118390395       118390500       BC005078_cds_0_0_chr2_118390396_r       0       -
34 chr2    220108689       220109267       AY125465_cds_0_0_chr2_220108690_f       0       +
35 chr2    220229609       220230869       NM_024536_cds_0_0_chr2_220229610_r      0       -
36 chr20   33330413        33330423        NM_181466_cds_0_0_chr20_33330414_r      0       -
37 chr20   33485370        33486123        BC085019_cds_1_0_chr20_33485371_f       0       +
38 chr20   33488491        33489122        NM_000557_cds_1_0_chr20_33488492_r      0       -
39 chr20   33513606        33513792        AF022655_cds_1_0_chr20_33513607_f       0       +
40 chr21   32687402        32687588        NM_032910_cds_0_0_chr21_32687403_f      0       +
41 chr21   32869641        32870022        NM_018277_cds_3_0_chr21_32869642_r      0       -
42 chr21   33321040        33322012        NM_005806_cds_1_0_chr21_33321041_f      0       +
43 chr21   33728358        33728724        AK129657_cds_0_0_chr21_33728359_r       0       -
44 chr22   30120223        30120265        NM_004147_cds_0_0_chr22_30120224_f      0       +
45 chr22   30160419        30160661        BC032941_cds_0_0_chr22_30160420_r       0       -
46 chr22   30228824        30228916        NM_001007467_cds_1_0_chr22_30228825_f   0       +
47 chr22   30340151        30340376        CR456540_cds_0_0_chr22_30340152_r       0       -
48 chr5    131311206       131311254       AF099740_cds_11_0_chr5_131311207_r      0       -
49 chr5    131424298       131424460       NM_000588_cds_0_0_chr5_131424299_f      0       +
50 chr5    131556601       131556672       BC035813_cds_0_0_chr5_131556602_r       0       -
51 chr5    131621326       131621419       BC003096_cds_0_0_chr5_131621327_f       0       +
52 chr6    108299600       108299744       NM_007214_cds_0_0_chr6_108299601_r      0       -
53 chr6    108594662       108594687       NM_003269_cds_0_0_chr6_108594663_f      0       +
54 chr6    108640045       108640151       NM_003795_cds_0_0_chr6_108640046_r      0       -
55 chr6    108722976       108723115       NM_145315_cds_0_0_chr6_108722977_f      0       +
56 chr7    113660517       113660685       AF467257_cds_1_0_chr7_113660518_f       0       +
57 chr7    116512159       116512389       NM_003391_cds_0_0_chr7_116512160_r      0       -
58 chr7    116714099       116714152       NM_000492_cds_0_0_chr7_116714100_f      0       +
59 chr7    116945541       116945787       AF377960_cds_0_0_chr7_116945542_r       0       -
60 chr8    118881131       118881317       NM_000127_cds_0_0_chr8_118881132_r      0       -
61 chr9    128764156       128764189       BC051300_cds_0_0_chr9_128764157_f       0       +
62 chr9    128787519       128789136       NM_014908_cds_0_0_chr9_128787520_r      0       -
63 chr9    128789552       128789584       NM_015354_cds_0_0_chr9_128789553_f      0       +
64 chr9    128850516       128850624       AB058751_cds_0_0_chr9_128850517_r       0       -
65 chrX    122745047       122745924       NM_001167_cds_1_0_chrX_122745048_f      0       +
66 chrX    152648964       152649196       NM_000425_cds_0_0_chrX_152648965_r      0       -
67 chrX    152691446       152691471       AF101728_cds_0_0_chrX_152691447_f       0       +
68 chrX    152694029       152694263       BC052303_cds_0_0_chrX_152694030_r       0       -
Note: See TracBrowser for help on using the browser.