root/test-data/6_indels.tabular

Revision 764:98c4d13dcc61, 1.6 kB (checked in by Greg Von Kuster <greg@bx.psu.edu>, 1 year ago)

Uncommented functional tests in some regVariation tools in preparation for moving them to main.

Line 
1 #Block  Source  Seq1_Start      Seq1_End        Seq2_Start      Seq2_End        Indel_length
2 1       hg18.chr1       3661    3662    16896   16898   2
3 3       hg18.chr1       5268    5269    18754   18759   5
4 3       hg18.chr1       5407    5408    18898   18900   2
5 3       hg18.chr1       5767    5768    19260   19261   1
6 4       hg18.chr1       6201    6202    19692   19697   5
7 4       hg18.chr1       6606    6607    20102   20111   9
8 4       panTro2.chr15   7705    7706    21208   21209   1
9 4       hg18.chr1       7756    7757    21260   21265   5
10 5       panTro2.chr15   9030    9032    22537   22538   2
11 6       hg18.chr1       9881    9882    23528   23530   2
12 6       panTro2.chr15   10179   10180   23826   23827   1
13 8       panTro2.chr12   10871   10876   77693624        77693625        5
14 8       hg18.chr1       10884   10885   77693634        77693635        1
15 8       hg18.chr1       10899   10900   77693650        77693657        7
16 8       hg18.chr1       10917   10918   77693675        77693677        2
17 8       hg18.chr1       10938   10939   77693698        77693713        15
18 8       panTro2.chr12   10969   10997   77693742        77693743        28
19 10      hg18.chr1       12912   12913   25544   25546   2
20 10      hg18.chr1       13080   13081   25714   25728   14
21 10      panTro2.chr15   14210   14212   26856   26857   2
22 10      panTro2.chr15   16311   16317   28955   28956   6
23 10      panTro2.chr15   16369   16372   29007   29008   3
24 10      panTro2.chr15   17283   17288   29918   29919   5
25 10      panTro2.chr15   17853   17857   30483   30484   4
26 11      panTro2.chr15   18306   18308   30931   30932   2
27 11      panTro2.chr15   18451   18453   31074   31075   2
28 11      panTro2.chr15   19740   19741   32361   32362   1
29 12      panTro2.chrUn   20735   20758   57104673        57104674        23
30 12      panTro2.chrUn   20782   20786   57104697        57104698        4
31 12      panTro2.chrUn   20794   20796   57104705        57104706        2
32 12      panTro2.chrUn   21077   21080   57104986        57104987        3
33 12      panTro2.chrUn   21582   21584   57105488        57105489        2
34 13      hg18.chr1       21818   21819   57107087        57107090        3
35 13      hg18.chr1       21859   21860   57107131        57107165        34
36 13      panTro2.chrUn   21878   21879   57107182        57107183        1
37 13      hg18.chr1       21978   21979   57107283        57107284        1
Note: See TracBrowser for help on using the browser.